El número de plantas en México bajo alguna categoría de riesgo se ha incrementado en los últimos años, pasó de 894 especies, subespecies o variedades en la NOM-059-ECOL-1994 a 981 en la NOM-059-ECOL-2001 y a 994 en la NOM-059-SEMARNAT-2010. En el estado de Yucatán, las selvas primarias casi han desaparecido, la selva baja caducifolia es el ecosistema que más ha sufrido la pérdida de su cobertura vegetal y actualmente quedan remanentes en su mayoría en estado secundario (Duno de Stefano et al.2017).

El tipo de vegetación dominante en el área protegida privada “Komchén de los Pájaros” está clasificada como Selva Baja Caducifolia (SBC) la que ha sido pobremente estudiada pese a que representa el 42% de los ecosistemas tropicales a nivel mundial que se consideran amenazados. En Yucatán, históricamente se debe al desmonte de la selva para el cultivo del henequén y el fomento agropecuario; hoy el cambio climático amenaza con provocar condiciones de aridez y desertificación en terrenos de por si secos. Los remanentes de esta selva se siguen perdiendo y fragmentando a pesar de estar bajo legislación. La vegetación de SBC se caracteriza por albergar una gran cantidad de especies endémicas de la región y constituye el ecosistema fundamental del área natural protegida privada (ANP). Cabe mencionar que la misma también se encuentra dentro del corredor mesoamericano, lo que implica una mayor responsabilidad en salvaguardar la diversidad faunística y florística que contiene.